Pedidos de confirmação em Javascript não são utilizados tão frequentemente como antigamente, principalmente devido a usos mais avançados do javascript e às novas caixas modais, mas ainda são úteis. Sempre que crio funcionalidades administrativas para os meus clientes, utilizo sempre um pedido de confirmação javascript antes de executar qualquer acção permanente – um exemplo é quando o cliente tenta eliminar algo.

<a href="http://dominio.com/admin/apagar-utilizador.php?utilizador_id=4" onclick="return confirm('Tem a certeza que deseja eliminar este utilizador?'); return false;">Eliminar Utilizador</a>